北宋时，普光塔院完成重修，改称为崇梵寺。早期崇梵寺，寺宇宏大，僧侣众多，香火鼎盛。可惜，清廷颁发迁海令，迁沿海三十里居民入内地，房舍拆毁，构筑木城为界，民不许出界外一步。崇梵寺属于被迁弃之列。康熙复界以后，僧寂星重建了崇梵寺，但是再也不能恢复到以前的繁荣和旧时规模了。

1993年，崇梵寺复归宗教使用，并恢复大雄宝殿，1999年,智才法师入主崇梵寺，决心中兴崇梵，先后修复放生池并重立放生池碑，重修寺庙，其营造法式，都仿照唐宋制，美轮美奂。2008年11月，台州市椒江区人民政府公布崇梵寺为椒江区重点文物保护单位。